A Lyon 2006-ban vásárolta meg a Monacótól a játékost, miután Squillacinak elévülhetetlen érdemei voltak a „nagyhercegségbeliek” Bajnokok Ligája ezüstérmében.
A hátvéd négy év után hagyta ott a francia bajnoki címvédőt, és csatlakozott az ebben az idényben csak az UEFA-kupában szereplő Sevilllához.
A 12-szeres válogatott bekk nem alkotott maradandót az Olympique-ben, és a klub mindenható elnöke, Jean-Michel Aulas nem is gördített akadályt a 2010-ig érvényes szerződéssel bíró játékos távozása elé.
A Sevilla ötödik új szerzeménye volt a nyáron Squillaci, miután Lautaro Acosta, Abdoulay Konko, Romaric és Fernando Navarro már aláírt Andalúziába.