Basso az Operación Puerto ügyben való érintettsége miatt két év eltiltást kapott és 2007-től 2009-ig nem versenyezhetett. A Liquigas kerekese a Gazzetta dello Sportnak adott interjúban beszélt fenntartásairól a szövetségi döntéssel kapcsolatban:
"Levelet fogok írni a szövetségnek. Nagyon fáj, hogy nem indulhatok a bajnokságon vagy a világbajnokságon. Erre nehéz magyarázatot adni, meg kell értenem, mi az oka ennek a döntésnek. Sokat gondolkoztam rajta, de nem fér a fejembe, mi értelme van ennek. Valóban ártottam ennek a sportágnak, amit szégyellek. De jó útra tértem, három dolgot tartok szem előtt: az őszinteséget, a fairplayt és a tisztaságot. Nem értem, a szövetség miért akarja megvonni tőlem most a lehetőséget, hogy indulhassak azon a két versenyen. Számomra ez személyes ügy, nem jogi eset, nem is a jogászom fordul a szövetséghez. Ha meg tudják magyarázni, miért nem indulhatok, fejet hajtok a döntés előtt."
Basso mellett több neves kerekest is érint a szövetségi rendelet, például Danilo Di Luca, Michele Scarponi, Davide Rebellin és Alessandro Petacchi is hasonló helyzetben van.
